Les différents types de structure des protéines et des acides nucléïques
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Les différents types de structure des protéines et des acides nucléïques |
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La structure primaire C'est la séquence en acides aminés, c'est-à-dire l'enchaînement des acides aminés reliés par une liaison appelée peptidique. Les propriétés physico-chimiques particulières des chaînes latérales des acides aminés confèrent leur structure aux protéines. |
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Les structures secondaires C'est l'ensemble des structures locales spécifiques qu'adoptent certaines parties d'une protéine. C'est une étape du repliement des protéines. Il existe 3 grands types de structures secondaires : les hélices a (à gauche ci-dessous) et les feuillets b (à droite ci-dessous). |
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Les structures secondaires sont elle-mêmes reliées le plus souvent par des boucles. Ci-contre, boucle à 2 résidus reliant 2 feuillets b ("two residues b-hairpin"). Source : "Super-secondary structure" (Cours "SwissProt") |
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Source : "Tertiary Protein Structure and folds" (Cours "SwissProt") |
Les structures super -secondaires ou motifs C'est une combinaison de structures secondaires. Ces combinaisons sont en nombre restreint. C'est une étape ultérieure du repliement des protéines, souvent associée à la formation des domaines structuraux. L'exemple ci-contre correspond à l'enchaînement de structures feuillet b - hélice a -feuillet b - hélice a - feuillet b, appelé pli Rossman (Michael Rossman, 1973), caractéristique du domaine de fixation des dinucléotides des déshydrogénases. |
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La structure tertiaire ou structure tridimensionnelle des protéines Parmi les innombrables structures que peut adopter une protéine, c'est la seule structure qui lui confère sa fonction biologique. Ci-contre, repliement tridimensionnel de la calmoduline, protéine impliquée dans la fixation du calcium. (Image générée avec CHIME®) |
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Les structures tridimensionnelles de l'ADN De gauche à droite ci-contre, structure de l'ADN A, B et Z. Source : "DNA" (Wikipedia) |
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Ci-contre, structure dun ARN de transfert impliqué dans la traduction. Source : "Transfer RNA " (Wikipedia) |
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La structure quaternaire Certaines protéines sont constituées de plusieurs chaînes polypeptidiques (appelées sous-unités) identiques ou non. La structure quaternaire est l'arrangement spatial de ces différentes sous-unités Ci-contre : structure tridimentionnelle de la glutamate déshydrogenase de boeuf compléxée au :
Auteurs : Smith, T. J., Peterson, P. E., Schmidt, T., Fang, J., Stanley, C. A. (2001) "Structures of Bovine Glutamate Dehydrogenase Complexes Elucidate the Mechanism of Purine Regulation" J. Mol. Biol. 307, 707 Classification : Oxidoreductase - EC: 1.4.1.3 |
