Figure de gauche :

Le groupe phosphate en position g d'une 1ère molécule d'ATP réagit avec le bicarbonate pour former du carbonyl phosphate.

L'attaque nucléophile de l'azote de l'ammoniac déplace le phosphate pour former un intermédiaire tétrahédrique.

Figure de droite :

Cet intermédiaire est déphosphorylé pour former du carbamate.

Enfin, le groupe phosphate g d'une seconde molécule d'ATP est transféré pour former le carbamylphosphate.

L'enzyme qui catalyse cette réaction est la carbamyl phosphate synthétase. Cette enzyme est l'une des enzymes prépondérantes des cellules hépatiques.  

Source : "Principe de Biochimie" ,  Horton, Moran, Ochs, Rawn, Scrimgeour (1994) (Ed. DeBoeck Université)