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Cours

1. La bioinformatique : définition, description, démarche et principales étapes

2. La bioinformation : molécules support, types et obtention

3. Complément sur les acides aminés et la structure primaire des protéines

4. Complément sur les ponts disulfure

5. Le stockage de la bioinformation : les banques de données

6. Quelques formats de fichiers dans les banques de données

7. Algorithmes et programmes de comparaison de séquences

8. Les matrices de substitutions

9. Les méthodes de séquençage

10. Le séquençage du génome humain

11. Quelques éléments à propos de la thérapie génique

12. Les puces à ADN

13. Protéomique - Notions théoriques

14. Métabolomique : modèle de recontruction métabolique

Applications

1. Fichiers et consultation des banques

2. Etude des protéines LEA ("Late Embryogenesis Abundant proteins")

3. Choix de matrices et/ou de valeurs de "gaps" pour l'alignement multiple

4. Analyse des sites de coupure des peptides signaux

5. Recherche et analyse de séquences de toxines

6. Étude protéomique de la RuBisCO

7. Analyse bioinformatique de la relation structure - fonction de la glutamate déshydrogénase

Recherche

LEA Protein database

Analyse statistique de données biologiques (cours de G. Hunault)

Bases d'informatique - phylogénie (cours de J.-M. Richer)

"PHP - MySQL" Welling & Thomson (Ed. PEARSON)

Propositions d'emplois en bioinformatique